Ichtyoplancton
Une des méthodes standard en halieutique est le suivi de
l'ichtyoplancton. Elle est utilisé pour estimer la taille d'un
stock reproducteur à partir du nombre d'œufs ou de larves
produit (par exemple, Rankine et Bailey 1987). Une condition
préalable nécessaire à de telles études est la capacité
d'identifier les œufs et les larves de poisson. Il a été
montré qu'en général, les systèmes informatisés, en
particulier les bases de données, peuvent faciliter cette tâche
(Froese et Schöfer 1987 ; Froese 1988, 1989 ; Froese et
al. 1989, 1990 ; Froese et Papasissi 1990 ; Froese
1990b). De plus, les caractères morphologiques des œufs et
des larves peuvent être utilisés pour tester des hypothèses au
sujet de stratégies de vie (par exemple, Froese 1990a).
Nous avons longtemps cherché une institution qui prendrait la
responsabilité de la mise à jour et du développement futur de
nos tables ichtyoplancton actuelles décrites ci-dessous. L'Institut
für Meereskunde, Kiel, Allemagne, a initié LarvalBase, une
version substantiellement plus élaborée des tables
ichtyoplancton de FishBase. Si vous êtes intéressés pour
collaborer à LarvalBase, veuillez visiter http
://www.ifm.unikiel.de/fi/bu/larvalbase/homepage_1.htm ou
contacter le Projet FishBase.
Références
Froese, R. 1988. The use of quadratic discriminant functions
in connection with video-based measurements for identification of
fish larvae. ICES C.M. 1988/L : 11, 8 p.
Froese, R. 1989. Computer-aided approaches to identification.
II. Numerical taxonomy. Fishbyte 7(3) : 25-28.
Froese, R. 1990a. Growth strategies of fish larvae. ICES C.M.
1990/L : 91, 20 p.
Froese, R. 1990b. Moderne Methoden zur Bestimmung von
Fischlarven. Universität Hamburg. Thèse de Doctorat.
260 p.
Froese, R. et C. Papasissi 1990. The use of modern relational
databases for identification of fish larvae. J. Appl. Ichthyol.
6 : 37-45.
Froese, R. et W. Schöfer 1987. Computer-aided identification
of fish larvae. ICES C.M. 1987/L : 23, 10 p.
Froese, R., W. Schöfer, A. Röpke et D. Schnack. 1989.
Computer-aided approaches to identification of aquatic
organisms : the use of Expert Systems. Fishbyte 7(2) :
18-19.
Froese, R., I. Achenbach et C. Papasissi 1990. Computer-aided
approaches to identification. III. (Conclusion). Modern
databases. Fishbyte 8(2) : 25-27.
Rankine, P.W. and R.S. Bailey. 1987. A report on the ICES
herring larval surveys in the North Sea and adjacent waters in
1986/1987. ICES C.M. 1987/H : 10, 15 p.
Rainer Froese
La table EGGS
Les œufs de poissons présentent une étonnante variété
de couleurs, de conformations, d'appendices, de tailles et de
milieux de développement. La table EGGS essaie de standardiser
ces informations pour faciliter leur identification ainsi que les
études comparatives.
Les champs
La table EGGS contient les Paramètres environnementaux
(Environmental parameters) auxquels sont généralement
associés l'observation des œufs, comme la Température
(Temperature), la Profondeur (Depth) sous
forme d'un intervalle, la Salinité (Salinity), le pH
(pH), et la teneur en Oxygène (Oxygen) de
l'eau. Remarques (Remarks) contient toute
information complémentaire sur l'environnement.
Milieu de développement (Place of development) :
Parmi les choix suivants : buoyant (pelagic) [flottant
(pélagique)] ; on the bottom (demersal) [sur le fond
(démersal)] ; fixed on plant or stone [attaché à une
plante ou un caillou] ; in sand or gravel [dans le sable ou
le gravier] ; in open nest [dans un nid ouvert] ; in covered
nest (i.e., burrow or tunnel) [en nid couvert (dans un terrier ou
un tunnel)] ; in bubble nest [dans un nid en mousse de
mucus] ; in mouth (mouthbrooders) [dans la bouche
(incubateur buccal)] ; attached to parental body [attaché
au corps parental] ; in brood pouch [en poche
incubatrice] ; in female (livebearers) [dans la femelle
(vivipares)] ; outside the water [à l'extérieur de
l'eau] ; in another animal (i.e., bivalve) [dans un autre
animal (bivalve)] ; other [autre].
Shape of egg [forme de l'œuf] : parmi les
choix suivants : spherical [sphérique] ; ovoid
[ovoïde] ; elongated [étiré] ; other [autre].
Attributes [attributs] : Parmi les choix
suivants : smooth [lisse] ; sculptured
[sculpté] ; with filaments [avec des filaments] ; with
tendrils [avec des vrilles] ; with stalk [avec un
pédicule] ; in jelly matrix [dans une matrice de
gelée] ; other [autre]. De plus, les œufs peuvent
être collants ou non collants.
Color of eggs [couleur des œufs] :
Parmi les choix suivants : transparent
[transparent] ; white [blanc] ; yellow,
orange, amber [jaune, orange, ambre] ; brown, black,
gray [marron, noir, gris] ; green [vert] ; other
[autre].
Color of oil globule(s) [couleur du(es) globule(s)
d'huile] Parmi les choix suivants : yellow [jaune] ;
orange/red [orange/rouge] ; green [vert] ; other
[autre].
Number of oil globules [nombre de globules d'huile] et
leur Diameter [diamètre], Egg diameter
[diamètre d'œuf] : Sous forme d'intervalles.
Perivitelline width [largeur du périvitellin] et Chorion
thickness [épaisseur du chorion] : Deux caractères
d'identification supplémentaires, qui peuvent être indiqués en
pourcentage d'un Reference diameter [diamètre de
référence].
Additional characters [caractères
supplémentaires] : Contient toute information
supplémentaire utile à l'identification.
Statut
La table EGGS contient des données sur plus de 250 espèces,
principalement de l'Atlantique Nord et de la Méditerranée,
extraites de plus de 200 références, entre autres Russell
(1976), Fahay (1983) et Moser et al. (1984). Aucun
contrôle sérieux n'a été fait jusqu'à présent. Il est donc
vraisemblable que la table contienne des erreurs. Nous aimerions
augmenter le nombre d'enregistrements de manière importante
(voir l'introduction du chapitre ‹
Ichtyoplancton › ci-dessus).
Comment y arriver
Cliquer sur le bouton Biology dans la vue SPECIES, puis
sur le bouton Reproduction dans la vue BIOLOGY et sur le
bouton Eggs dans la fenêtre REPRODUCTION.
Références
Fahay, M. 1983. Guide to the stages of marine fishes occurring
in the Western North Atlantic, Cape Hatteras to the Southern
Scotian shelf. J. Northwest Atlantic Fish. Sci. 4, 423 p.
Moser, H.G., W.J. Richards, D.M. Cohen, M.P. Fahay, A.W.
Kendall, et S.L. Richardson, Éditeurs. 1984. Ontogeny and
systematics of fishes. Am. Soc. Ichthyol. Herpetol. Spec. Publ.
1, 760 p.
Russell, F.S. 1976. The eggs and planktonic stages of British
marine fishes. Academic Press, London. 524 p.
Rainer Froese
La table EGGDEV
Que les œufs de poissons se développent plus rapidement
à haute qu'à basse température est au moins connu depuis
Dannevig (1895), et ce thème a été développé - et quantifié
- par de nombreux auteurs (voir Pauly et Pullin 1988, et Fig.
40). L'effet des facteurs autres que la température sur le
développement des œufs a été moins étudié : aucun
ensemble de données n'est actuellement disponible (en dehors de
FishBase) pour identifier clairement ces facteurs et pour
quantifier leurs effets pour un grand nombre d'espèces de
poissons. La seule exception est la taille des œufs,
généralement exprimée par leur diamètre.
Plusieurs auteurs ont noté que les grands œufs se
développent, toutes choses étant égales par ailleurs, plus
lentement que les petits œufs (voir par exemple Breder et
Rosen 1966). Cependant, Pauly et Pullin (1988) ont fourni ce qui
était peut-être la première démonstration de cet effet sur de
nombreuses espèces, grâce à la compilation des durées de
développement, des diamètres et des températures
correspondantes pour les œufs de 84 espèces de
téléostéens extraits de 50 références. Cette compilation a
constitué la base de la table EGGDEV.
Les champs
Egg development time [Temps de développement de
l'œuf] : Indique la durée entre la ponte/fécondation
et l'éclosion, en jours ; idéalement, cette durée devrait
faire référence au temps pour lequel 50 % des œufs sont
éclos, mais fait souvent référence au milieu d'une gamme.
Egg diameter [Diamètre de l'œuf] : En
mm ; il devrait être remplacé par le diamètre d'une
sphère équivalente au volume des œufs qui sont
non-sphériques comme chez les Engraulidae par exemple.
Water temperature [Température de l'eau] : Indique
la température moyenne en °C à laquelle les œufs ont
été exposés.
Salinity [Salinité] : Indique en ‰ la valeur
et le type de salinité parmi les choix suivants : seawater
[eau de mer] ; brackish water [eau saumâtre] ; et
freshwater [eau douce].
Data type [Type de données] : Parmi les choix
suivants : based on field data [d'après des données de
terrain] ; based on laboratory experiments [d'après des
expériences de laboratoire] ; based on aquarium
observations [d'après des observations en aquarium ] ;
other [autre].
Remarks [Remarques] : Contient toute information
supplémentaire, par exemple sur le diamètre-équivalent
sphérique, ou sur le type d'acquisition des données.
Reference [Référence], Locality [Localité] et
Country [Pays] : Voir les tables précédentes.
Utilisations
Pauly et Pullin (1988) ont proposé un modèle (log linéaire)
de régression multiple pour prédire la durée de développement
de l'œuf connaissant la température de l'eau et le
diamètre de l'œuf. Grâce à l'ensemble des données
aujourd'hui augmenté dans la table EGGDEV, ce modèle peut
évidemment être amélioré. Par exemple, en incluant
éventuellement des variables établies pour forcer les
groupements taxinomiques, il serait possible de tester
l'assertion de Pauly et Pullin selon laquelle la durée de
développement des œufs ne dépend pas de la position
taxinomique des espèces, à température et diamètre égaux. Le
test de cette hypothèse peut avoir des implications importantes
sur les théories biologiques.
De plus, la taille et la durée de développement des
œufs sont des informations très importantes pour tous les
élevages de poissons car elles peuvent influencer l'agencement
des écloseries et la gestion aquacole durant toutes les phases
du cycle de vie en captivité.
Les petits œufs produisent des petites larves avec des
petites bouches qui sont souvent plus difficiles à nourrir que
les grandes larves. Par conséquent, la table EGGDEV peut fournir
des indices sur les exigences et les succès possibles d'une
reproduction en captivité. C'est important pour les nouvelles
espèces considérées comme potentielles pour l'aquaculture.
| Encadré 27. La température et le
développement des œufs de poissons. Depuis
un siècle, les scientifiques savent que la durée
requise entre la fécondation et l'éclosion des
œufs de poissons diminue quand la température
croît. Cette connaissance est peut-être plus ancienne,
car probablement acquise par les pisciculteurs qui ont
élevé la carpe en Chine ancienne, ou en Europe
médiévale par exemple.
Les deux graphiques FishBase qui illustrent le
développement d'œuf d'après les seules données de
la table EGGDEV, ne tiennent pas compte seulement de la
température mais aussi de la taille des œufs, un
facteur qui a reçu moins d'attention jusqu'à présent,
bien qu'il affecte aussi le développement des œufs
(Pauly et Pullin 1988).
Une courbe de la durée de développement des œufs
en fonction de la température (voir Fig. 40)
différencie les œufs de 1 mm de diamètre ou
moins des œufs plus grands ; elle montre
clairement que, à une température donnée, les
œufs plus petits se développent plus rapidement que
les œufs plus grands.
Ce thème est approfondi par la deuxième courbe
(Fig. 41) de la durée de développement des
œufs ajustée à la température en fonction du
diamètre, qui illustre, comme attendu, une tendance
croissante, malgré une augmentation simultanée de la
variance. L'unité de l'axe des abscisses correspond
approximativement aux degrés-jours des praticiens, mais
est exprimée en degrés Kelvin (Kelvin =  C + 273,16) pour assurer la
linéarité sur un large intervalle de températures.
Référence
Pauly, D. et R.S.V. Pullin. 1988. Hatching time in
spherical, pelagic, marine fish eggs in response to
temperature and egg size. Environ. Biol. Fish.
22(4) : 261-271.
Daniel Pauly
|
Fig. 40. Durée de développement moyenne
des œufs de poissons en fonction de la température moyenne
de l'eau dans laquelle ils se sont développés et de leur
diamètre. Voir Encadré 27 pour une interprétation de ce
graphique.
Fig. 41. Durée de développement des
œufs de poissons ajustée à la température en fonction de
leur diamètre. Voir Encadré 27 pour une interprétation de
ce graphique.
Comment y arriver
Cliquer sur le bouton Biology dans la vue SPECIES, puis
sur le bouton Reproduction dans la vue BIOLOGY. et sur le
bouton Egg dev. dans la fenêtre REPRODUCTION.
Double-cliquer sur une des lignes dans la vue LIST OF EGG
DEVELOPMENT TIMES affiche les informations relatives au
développement désigné.
Références
Breder, C.M., Jr. et D.E. Rosen. 1966. Modes of reproduction
in fishes. T.F.H. Publications, Neptune City. 941 p.
Dannevig, H. 1895. The influence of temperature on the
development of the eggs of fishes. Rep. Fish. Board Scotland
1894 : 147-152.
Pauly, D. et R.S.V. Pullin. 1988. Hatching time in spherical,
pelagic, marine fish eggs in response to temperature and egg
size. Environ. Biol. Fish. 22(4) : 261-271.
Daniel Pauly et Roger S.V. Pullin
La table LARVAE
Les caractères morphologiques des larves de poissons, ainsi
que leur niche écologique, changent radicalement au cours du
développement larvaire, la période comprise entre l'éclosion
et la métamorphose. C'est vrai pour les proportions du corps
aussi bien que pour la pigmentation. Les épines, les dents et
les rayons des nageoires commencent à apparaître vers la
moitié du développement larvaire. Une telle variabilité rend
l'identification d'une larve de poisson très difficile.
Froese (1990) a développé et comparé différentes méthodes
informatisées pour l'identification des larves de poissons :
la taxinomie numérique, les systèmes experts et les bases de
données relationnelles. Il en a conclu que globalement,
l'approche des bases de données était la plus facile à
appliquer et à utiliser, parce que la plupart des larves
pouvaient être identifiées par une combinaison restreinte de
caractères (voir aussi Froese 1988, 1989 ; Froese et al.
1989, 1990 ; Froese et Papasissi 1990).
Sources
La table LARVAE contient des données sur plus de 300
espèces, principalement de l'Atlantique Nord et de la
Méditerranée, extraites de plus de 300 références, entre
autres d'Ancona (1956), Russell (1976), Fahay (1983), Moser et
al. (1984) et Halbeisen (1988). Il est prévu d'inclure les
nombreuses publications récentes sur les larves de poissons,
mais voir supra l'introduction du chapitre
‹ Ichtyoplancton › concernant LarvalBase et
ses collaborateurs potentiels.
Les champs
Pour les post-larves (c'est-à-dire les larves dans une phase
de développement entre la résorption totale du sac vitellin et
la métamorphose), la table comprend les champs suivants : Length
at first feeding [Longueur à la 1ère alimentation] ; Months
[Mois], le mois de l'année d'apparition des larves ; les
paramètres usuels de l'eau : Depth
[Profondeur] ; Temperature [Température] ; Salinity
[Salinité] ; Oxygen [Oxygène], en concentration.
À cause de leur variabilité, de nombreux caractères,
méristiques et morphométriques, sont indiqués sous forme d'un
intervalle des phases ‹ précoces › aux phases
‹ tardives ›.
Pour les caractères descriptifs, la table intègre des Striking
features [Caractéristiques remarquables] comme
‹ les yeux pédonculés › ou ‹ un
museau en forme de tube ›, et des Striking shape
[Formes remarquables] comme ‹ en forme
d'anguille › ou ‹ en forme de têtard ›.
Car ces caractéristiques étant rares, elles réduisent
drastiquement le nombre d'espèces possibles au cours d'un
processus d'identification.
Shape of gut [Conformation de l'intestin] :
Caractère également distinctif, parmi les choix suivants :
triangular [triangulaire] ; spherical or looped [sphérique
ou en boucle] ; elongated [étiré] ; tube-like [en
forme de tube] ; aberrant [aberrant].
Gas bladder [Vessie gaseuse] : Parmi les champs
suivants : visible [visible] ; invisible
[invisible] ; pigmented [pigmentée].
Spinal armature [Épines] : Indique l'emplacement
d'épines à divers endroits sur la tête.
Rows on tail [Rangées sur la queue] : Indique
l'emplacement de mélanophores parmi les choix suivants :
dorsal row [Rangée dorsale] ; ventral row [Rangée
ventrale] ; lateral row [Rangée latérale] ; dorsal +
ventral row [Rangée dorsale + ventrale] ; dorsal + lateral
row [Rangée dorsale + latérale] ; ventral + lateral row
[Rangée ventrale + latérale] ; dorsal + lateral + ventral
row [Rangée dorsale + latérale + ventrale] ; no rows
[Aucune rangée]. Il a été montré que ces motifs de
pigmentation sont des caractères très efficaces pour identifier
les larves de poissons (Halbeisen 1988 ; Froese 1990).
Other melanophores [Autres mélanophores] :
Indique en deux champs l'emplacement de mélanophores
supplémentaires sur la queue et la présence de mélanophores
sur la tête et le tronc.
Urostyle region [région de l'urostyle] et Peritoneum
[Péritoine] peuvent être pigmentés ; Pectorals
[Pectorales] et Pelvics [Pelviennes] peuvent être
absentes ou avoir des formes remarquables, avec ou sans
mélanophores.
Meristic characters [Caractères méristiques] :
Indique le nombre total et préanal des myomères
ou des vertèbres.
Additional characters of postlarvae [Caractères
supplémentaires] : Contient tout caractère supplémentaire
sur les post-larves.
Enfin, la table LARVAE comprend des champs qui contiennent des
caractères métriques pour 3 phases post-larvaires, précoce,
flexion et tardive, rapportés à une Reference length
[Longueur de référence] : Preanal length [Longueur
préanale], Prepectoral length [Longueur prépectorale], Preorbital
length [Longueur préorbitale], Diameter of eye
[Diamètre de l'œil], Depth at eye [Hauteur du corps
au niveau de l'œil], Depth at pectorals [Hauteur du
corps au niveau des pectorales], Depth at anus [Hauteur du
corps au niveau de l'anus].
Pour la larve vésiculée (avec le sac vitellin non
résorbé), la table comprend les champs suivants : Larval
area [Aire larvaire] : Indique l'aire de répartition
géographique typique des larves ; Place of development
[Milieu de développement] : Voir la table EGGS pour la
liste des choix ; Length at birth [Longueur à la
naissance] ; Preanal length [Longueur
préanale] : en pourcentage de la longueur totale ; Yolk-sac
[Sac vitellin] : deux champs indiquent sa forme et sa
pigmentation ; Yolk [Vitellus] : indique sa
consistance ; Oil globules [Globules huileux] :
trois champs indiquent leur nombre, position et pigmentation dans
le vitellus.
Trois champs décrivent la pigmentation des larves
vésiculées sur la tête, le tronc et la queue parmi les
modèles observés les plus communs. Cette description est une
information essentielle à des fins d'identification. Additional
characters [Caractères supplémentaires] : Contient
tout caractère supplémentaire sur les larves vésiculées.
Comment y arriver
Cliquer sur le bouton Biology dans la vue SPECIES, puis
sur le bouton Reproduction dans la vue BIOLOGY et sur le
bouton Larvae dans la fenêtre REPRODUCTION.
Remerciements
Je rend hommage à la contribution de feu Hans-Wilhelm
Halbeisen qui a montré que les modèles de pigmentation chez les
larves de poissons peuvent être classifiées. Il a développé,
en se fondant sur cette découverte, la première clef
d'identification concise des larves de poissons pour une grande
zone. De nombreuses illustrations de larves dans FishBase sont
tirées des illustrations de sa clef (Halbeisen 1988). Je
remercie aussi Wolfgang Welsch pour son aide à la numérisation
de nombreuses illustrations de larves. Enfin, je remercie
Christine Papasissi qui a effectué de nombreuses mesures pour la
partie morphométrie de la table LARVAE.
Références
d'Ancona, U. 1956. Uova larve e stadi giovanili di Teleostei.
Ordine Synentognathi, Famiglia 1 : Scomberesocidae. Fauna
Flora Golfo Napoli, Monogr. 38 : 157-164.
Fahay, M. 1983. Guide to the stages of marine fishes occurring
in the Western North Atlantic, Cape Hatteras to the Southern
Scotian shelf. J. Northwest Atlantic Fish. Sci. 4, 423 p.
Froese, R. 1988. The use of quadratic discriminant functions
in connection with video-based measurements for identification of
fish larvae. ICES C.M. 1988/L : 11, 8 p.
Froese, R. 1989. Computer-aided approaches to identification.
II. Numerical taxonomy. Fishbyte 7(3) : 25-28.
Froese, R. 1990. Moderne Methoden zur Bestimmung von
Fischlarven. Universität Hamburg. Thèse de Doctorat.
260 p.
Froese, R., W. Schöfer, A. Röpke et D. Schnack. 1989.
Computer-aided approaches to identification of aquatic
organisms : the use of Expert Systems. Fishbyte 7(2) :
18-19.
Froese, R., I. Achenbach et C. Papasissi. 1990. Computer-aided
approaches to identification. III. (Conclusion). Modern
databases. Fishbyte 8(2) : 25-27.
Froese, R. et C. Papasissi. 1990. The use of modern relational
databases for identification of fish larvae. J. Appl. Ichthyol.
6 : 37-45.
Halbeisen, H-W. 1988. Bestimmungschlüssel für Fische der
Nordsee und angrenzender Gebiete. Ber. Inst. Meereskd. 178,
76 p.
Moser, H.G., W.J. Richards, D.M. Cohen, M.P. Fahay, A.W.
Kendall, et S.L. Richardson, Éditeurs. 1984. Ontogeny and
systematics of fishes. Am. Soc. Ichthyol. Herpetol. Spec. Publ.
1, 760 p.
Russell, F.S. 1976. The eggs and planktonic stages of British
marine fishes. Academic Press, London, 524 p.
Rainer Froese
La table LARVDYN de Houde et Zastrow
La table LARVDYN a été développée par Edward D. Houde et
Colleen E. Zastrow (1993) qui l'a fournie à FishBase pour
étendre sa diffusion. Nous citons leur publication
(p. 290) :
« Les taux de croissance et de mortalité, et les bilans
énergétiques des larves de poissons diffèrent selon les
espèces et les écosystèmes. Dans cette synthèse, nous avons
évalué les taux d'ingestion requis pour une croissance moyenne
des larves, et développé des bilans énergétiques. Le taux de
croissance spécifique (en poids ; G) ; le taux de
mortalité totale (Z) ; la durée de la phase larvaire
(D) ; l'efficacité de conversion alimentaire (K1) ; et
la consommation d'oxygène spécifique (QO2) ont été obtenus de
la littérature et regroupés par espèce d'eau douce ou marine.
[…] Une analyse de covariance a été utilisée pour
permettre la comparaison des valeurs moyennes entre écosystèmes
et taxa. »
La table contient des données pour environ 100 espèces
extraites de plus de 200 références. Ces informations sont
utilisées pour produire différents types de graphiques. La
Fig. 42 en est une illustration. Nous projetons d'étendre
cette couverture au fur et à mesure que de nouvelles
informations deviendront disponibles. Données et questions des
utilisateurs de FishBase seront appréciées.
Fig. 42. Mortalité en fonction du taux de
croissance chez les larves. Points clairs : toutes les
espèces dans FishBase ; point noir : Clupea
harengus.
Comment y arriver
Cliquer sur le bouton Biology dans la vue SPECIES, puis
sur le bouton Reproduction dans la vue BIOLOGY et sur le
bouton Larval dyn. dans la fenêtre REPRODUCTION.
Référence
Houde, E.D. et C.E. Zastrow. 1993. Ecosystem- and
taxon-specific dynamic energetics properties of fish larvae
assemblages. Bull. Mar. Sci. 53(2) : 290-335.
Rainer Froese